Романы
* 1960 – Джим Пуговица и Лукас-машинист (Jim Knopf und Lukas der Lokomotivführer)
* 1962 – Джим Пуговица и чертова дюжина (Jim Knopf und die Wilde 13)
* 1972 – Момо или Странная история о ворах времени и о ребенке, который возвращал украденное время людям (Momo oder Die Seltsame Geschichte von den Zeit-Dieben und von dem Kind, das den Menschen die gestohlene Zeit zurückbrachte)
* 1979 – Бесконечная история (Die unendlichen Geschichte)
* 1984 – Гогголори (Der Goggolori)
* 1989 – Катастрофанархисториязвандалкогольный пунш желаний (Der satanarchäolügenialkohölische Wunschpunsch)
Сборники
* 1969 – Das Schnurpsenbuch – сборник стихотворений абсурда и магических заклинаний
* 1983 – Зеркало в зеркале: Лабиринт (Der Spiegel im Spiegel. Ein Labirinth) – сборник переплетающихся между собой рассказов
* 1984 – Пожиратель снов (Trödelmarkt der Träume) – серенады и стихотворения
* 1992 – Тюрьма свободы (Das Gefängnis der Freiheit)
* 1994 – «Школа колдовства» и другие истории (Die Zauberschule und andere Geschichten)
Антологии
* 1983 – Моя книга для чтения (Mein Lesebuch)
* 1989 – Книга для чтения Михаэля Энде (Das Michael Ende Lesebuch)
Другие произведения
* 1947 – Настоятельное время (Denn die Stunde drängt) – пьеса (не опубликована)
* 1950 – Высокий султан (Sultan hoch zwei) – пьеса (не опубликована)
* 1955 – Безобразные (Die Hässlichen) – пьеса (не опубликована)
* 1959 – Пионовый фонарь (Die Päonienlaterne) – пьеса для радио (не опубликована), история о японских привидениях
* 1967 – Die Spielverderber – пьеса (премьера состоялась 17 мая во Франкфурте)
То же: 1989 – дополненный и расширенный вариант под названием «Die Spielverderber oder: Das Erbe der Narren»
* 1972 – Транквилла Трампелтри или Настойчивая черепаха (Tranquilla Trampeltreu oder Die beharrliche Schildkröte) – иллюстрированная книга
* 1978 – Маленький оборванец (Das kleine Lumpenkasperle) – иллюстрированная книга
* 1978 – Лирум Ларум Вилли Варум (Lirum Larum Willi Warum) – иллюстрированная книга
* 1981 – Славный червяк и бабочка или Странный обмен (Der Lindwurm und der Schmetterling oder Der seltsame Tausch) – иллюстрированная книга
* 1982 – Швейная машинка Тени (Die Schattennähmaschine)
* 1982 – Сказка Гауклера (Das Gauklermärchen) – опера, написанная вместе с Герхардом Концелманном (Gerhard Konzelmann)
* 1982 – Фантастика / Культура / Политика (Phantasie / Kultur / Politik) – протокол беседы с журналистами Эрхардом Эпплером (Erhard Eppler) и Ханной Тачи (Hanne Tächl)
* 1984 – Баллада Норберта Накендика, или Голый носорог (Die Balade von Norbert Nackendick oder Das nackte Nashorn) – иллюстрированная книга
* 1984 – Filemon Faltenreich – иллюстрированная книга
* 1985 – Археология тьмы (Die Archäologie der Dunkelheit) – книга о жизни и творчестве Эдгара Энде / в соавт. с Йоргом Крихбаумом (Jörg Krichbaum)
* 1988 – Теневой театр Офелии (Ophelias Schattentheater) – иллюстрированная книга
* 1988 – Охота на Шларга (Die Jagd nach dem Schlarg) – вариация на тему поэмы Л. Кэрролла «Охота на Снарка»
* 1989 – Искусство и политика (Kunst und Politik) – беседа с Йозефом Бейсом (Joseph Beuys)
* 1990 – Истории о Шасселле и Лопфеле (Die Geschichte von der Schüssel und vom Löpfel) – иллюстрированная книга
* 1991 – Lenchens Geheimnis
* 1991 – Das Traumfresserchen – вокальная партия
* 1992 – Долгая дорога после Санта Круз (Der lange Weg nach Santa Cruz)
* 1993 – Крысолов (Der Rattenfänger) – музыкальный рассказ М. Энде и У. Хиллера
* 1993 – Тедди и звери (Teddy und die Tiere)
* 1993 – Легенда полнолуния (Die Vollmondlegende) – иллюстрированная книга для взрослых
* 1994 – Картотека Михаэля Энде: Эскизы и заметки (Michael Endes Zettelkasten. Skizzen und Notizen)
* 1995 – Маммонелла, или Дух в бутылке (Mammonella oder Der Geist in der Flasche) – незаконченное произведение для театра
Фильмография
* 1961 – Джим Пуговица и Лукас-машинист (Jim Knopf und Lukas der Lokomotivführer) – мини-телесериал
* 1962 – Джим Пуговица и чертова дюжина (Jim Knopf und die wilde Dreizehn) – мини-телесериал
* 1976 – Джим Пуговица и Лукас-машинист (Jim Knopf und Lukas der Lokomotivführer) – мини-телесериал
* 1977 – Джим Пуговица и чертова дюжина (Jim Knopf und die wilde 13) – мини-телесериал
* 1984 – Бесконечная история (Die unendliche Geschichte) – ФРГ
То же: 1984 – Под названием «The NeverEnding Story»
* 1986 – Момо (Momo) – ФРГ-Италия
* 1990 – Бесконечная история 2: В поиске Фантазии (Die unendliche Geschichte II: Auf der Suche nach Phantasien) – Германия
То же: 1990 – Бесконечная история 2: Следующая глава (The NeverEnding Story II: The Next Chapter)
* 1995 – Бесконечная история 3: Спасение Фантазии (Die unendliche Geschichte III – Rettung aus Phantasien) – Германия
То же: 1995 – Бесконечная история 3 (The NeverEnding Story III)
* 1996 – Бесконечная история (Die Unendliche Geschichte) – мультсериал (Канада – Франция – Германия)
То же: 1996 – «The NeverEnding Story»
* 2000 – Джим Пуговица (Jim Knopf) – телесериал
То же: 2000 – «Джим Пуговица» (Jim Bouton)
* 2000 – Волшебный пунш (Wunschpunsch) – телесериал
* 2001 – «Истории из «Бесконечной истории» (Tales From the Neverending Story) – телесериал (Канада)
* 2001 – Момо – спаситель времени (Momo alla conquista del tempo)
То же: 2001 – «Момо» (Momo)